Вначале станция называлась "Гагра-Пассажирская" и была главной в курортном городе. Здесь останавливались все поезда по пути следования Адлер – Сухум.
Позже, уже в 50-х годах, после открытия центрального вокзала в Новой Гагре, "Гагра-Пассажирская" потеряла свой статус, станцию реорганизовали в остановочный пункт и потом дважды переименовывали. В 70-х годах станцию назвали "Гагра-Павильон". Современное наименование она получила в начале 90-х.
После Отечественной войны народа Абхазии 1992-1993 годов станция пришла в упадок. Постепенно разрушались некогда величественные колонны и лепнина на стенах.
Сегодня "Гагрипш" закрыт для приема и отправки пассажиров. В начале 2022 года в компании "Абхазская железная дорога" заявили о намерении расчистить территорию станции и начать работы по консервации объекта до начала масштабной реставрации.