Он возведен в XI веке на месте одного из семи главных абхазских святилищ - Елыр-ныха. Название происходит от абхазского слова "аилыргара", что переводится как "правосудие”.
В 1733 году храм в Илоре разорили турки. Но иконы, кресты и другие реликвии удалось спрятать и сохранить.
В Илорском храме хранились древние иконы и различные приношения покровителю церкви и окрестных земель. Во второй половине XIX века в ризнице еще оставалось множество предметов старины, в том числе знаменитая золотая бедийская чаша. В церкви также была серебряная илорская чаша X века. Но она была утеряна.
Сегодня в церкви хранятся частицы мощей Георгия Победоносца, а также мироточащие и кровоточащие иконы.